Como complemento a los programas de monitoreo de fitoplancton nocivo y toxinas marinas iniciados en la década de los años noventa,  se estimó necesario incorporar actividades destinadas a lograr un mejor conocimiento de este fenómeno en las personas,  para lograr un mejor comportamiento de la población con relación a estos eventos y particularmente en relación a la medidas que adopta la autoridad, tanto para proteger la salud pública como para minimizar los impactos sobre las actividades productivas.

Para tal efecto se desarrolló a partir de 1997 hasta el año 2004 el Proyecto “Difusión Programa  Marea Roja en la XII región” financiado por el Fondo Nacional de Desarrollo Regional (FNDR), que incorporaba junto al monitoreo los componentes de educación formal y no formal destinado a los profesores y alumnos de la región; capacitación a diferentes grupos representativos por su función, profesión u oficio, para fortalecer el nivel de conocimiento y comprensión, y de difusión que incorporaba elementos de comunicación orientados a robustecer la diseminación de la información relevante del fenómeno y secundariamente fortalecer la educación de la comunidad. Tanto la educación como la capacitación apuntaban al desarrollo de habilidades y conductas responsables por parte de la comunidad. Históricamente la difusión fue una tarea de carga de la autoridad de salud, en tanto que los otros aspectos han sido abordados por el Instituto. A partir de 2005 el Departamento de Medio Ambiente de la Secretaría Regional Ministerial de Salud de Magallanes, ha asumido dicha tareas, contratando al Instituto, para que aborde acciones operacionales sobre el particular.

En la actualidad, este proyecto comprende acciones destinadas a lograr en el mediano y largo plazo ciudadanos con un conocimiento integro que hagan posible una convivencia con la marea roja y sus efectos, instaurando en ellos, conductas responsables.

Para estos efectos, se implementan diferentes estrategias de trabajo, tales como: como instruir en la temática de las FAN a personas involucradas en las áreas productivas y de fiscalización, tanto públicos como privados; medir el grado de conocimiento que ha adquirido el sector pesquero artesanal en torno al fenómeno de la marea roja, evaluar el conocimiento de la comunidad en general respecto del tema, diseñar y entregar material educativo didáctico a los establecimientos educacionales de la región; así como también, montaje de exposiciones, charlas y talleres a la comunidad en general.